近年来，企业为留住人才、提升职工福利，往往会与医疗院所签订员工健康检查协议，并由企业负担该健检费用，财政部南区国税局於近期查核案件中发现，企业列报上开健检费用支出，却未依所得税法之规定办理员工薪资扣缴之情形。 该局指出，员工由服务单位支领或给付之健康检查费，系属职务上取得之补助费，核属所得税法第14条第1项第3类规定之薪资所得，公司依法应办理薪资扣缴，惟若该检查系依「劳工安全卫生法」第12条第1项规定对於在职劳工应施行之定期健康检查，及对於从事特别危害健康之作业者，应定期施行特定项目之健康检查，得不视为该员工之薪资所得，免予扣缴。 因此，事业给付员工健康检查费用，应先探究其给付之性质，是否属应扣缴之薪资，以免因漏扣缴而遭受处罚，影响自身权益。